단일 셀 라이브러리 준비

성공적으로 형질 도입 된 세포를 선택한 후 scRNA-seq 를 수행하기 위해 단일 세포의 분리가 필요합니다. Perturb-seq 와 CROP-seq 는 단일 세포 분리를 위해 액적 기반 기술을 사용하여 수행되었으며, 반면 밀접하게 관련된 CRISP-seq 는 마이크로 웰 기반 드로우를 사용하여 수행되었습니다. 일단 세포가 단일 세포 수준에서 분리되면 역 복사, 증폭 및 시퀀싱이 발생하여 각 세포에 대한 유전자 형태의 발현 프로파일을 생성합니다. 많은 scRNA-seq 접근 방식은 역방향 복사 단계에서 고유 한 분자 식별자 (UMI)와 세포 바코드를 통합하여 개인을 인덱싱합니다. RNA 분자와 세포 각각. 이러한 추가 바코드는 RNA 전 사체를 정량화 하고 각 서열을 기원 세포와 연관 시키는 데 도움이 됩니다.

이미지 240A | Perturb-seq 워크 플로 개요 | Sdlee94 / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Overview_of_Perturb-seq_workflow.jpeg) from Wikimedia Commons

저자 : Milos Pawlowski

참고 문헌:

분자 생물학 기술 II

분자 생물학 V의 기술